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O Tomboy substitui os Post-Its grudados no monitor, além de ser ótimo para anotações rápidas e lembretes. O recurso mais poderoso do Tomboy é um sistema interno de wiki, que permite a ligação entre anotações. Por exemplo, um item pode trazer informações sobre um contato e uma anotação fazer referência à pessoa, com um link direto para os textos relevantes. Na interface do Ubuntu, baseada no Gnome, o Tomby fica sempre acessível por um ícone na parte superior da tela, facilitando a inclusão de novas anotações ou a busca por textos já digitados. As anotações podem ter trechos com texto sublinhado grifado ou outros efeitos de fontes e cores. Além disso, o Tomboy pode receber mais recursos com o uso de plug-ins, como integração com o Evolution (arraste um e-mail para o Tomboy, para criar uma anotação associada), exportação de textos para HTML, entre outros.
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